Wie die echte Dreiflüssestadt Passau an Inn, Ilz und Donau, wurde auch Vilshofen regelmäßig von Hochwassern heimgesucht. Besonders dramatisch war die Überschwemmung des Jahres 1956: Über die begrünte, sich zur Donau hinstreckende Lände, die die abgetragene mittelalterliche Stadtmauer ersetzte, drang das Wasser mit einem Pegel von 7 Metern in die Altstadt.

Daraufhin errichtete man im folgenden Jahr Hochwasserdämme, auf denen zeitgleich die Bundesstraße 8 ausgebaut wurde. Durch diese Maßnahme war Vilshofen zwar geschützt, verlor aber den Zugang zur Donau. Dazu kam, dass der Fernverkehr eine attraktive Ufergestaltung verhinderte.

In den 1990er-Jahren schüttete man vor dem Damm eine Bank auf, die als Uferpromenade mit Bootsanlegestegen dient.

Derzeit plant das Staatsbauamt eine Ortsumgehung an der B 8, um das örtliche Verkehrsaufkommen von täglich 20000 Kraftfahrzeugen zu senken.